3、正文部分
<rdf:RDF
    xmlns:rdf="&rdf;"
    xmlns:owl="&owl;"
    xmlns:xsd="&xsd;"
    xmlns:rdfs="&rdfs;"
    xml:base="http://example.org.cn/" >
...................
</rdf:RDF>

可是当我们用OntModel对象来实现的时候，最后生成的文件只有第三3（正文部分）。程序如下：
OntModel ont = ModelFactory.createOntologyModel(OntModelSpec.OWL_MEM, null);
FileOutputStream out1 = new FileOutputStream("./foo.owl");
ont.write(out1,"RDF/XML","http://example");

生成的foo.owl文件如下：
<rdf:RDF
    xmlns:rdf="http://www.w3.org/1999/02/22-rdf-syntax-ns#"
    xmlns:owl="http://www.w3.org/2002/07/owl#"
    xmlns:xsd="http://www.w3.org/2001/XMLSchema#"
    xmlns:rdfs="http://www.w3.org/2000/01/rdf-schema#" >
</rdf:RDF>

由上看，Model的write方法是没有办法设置第1部分（xml编码格式）和第2部分。而且，xml:base属性在OntModel中是无法设置的。setNsPrefix只能设置xmlns下的属性。

但是RDFWriter类却可以做这样的工作。
OntModel marray = ModelFactory.createOntologyModel(OntModelSpec.OWL_MEM, null);
RDFWriter rdfwriter = marray.getWriter();
rdfwriter.setProperty("showXmlDeclaration","true");
rdfwriter.setProperty("showDoctypeDeclaration","true");
rdfwriter.setProperty("xmlbase","http://example.org.cn/");
FileOutputStream out1 = new FileOutputStream("./foo.owl");
rdfwriter.write(marray, out1, "http://example.org/");

最后生成的foo.owl文件如下：
<?xml version="1.0"?>
<!DOCTYPE rdf:RDF [
  <!ENTITY rdfs 'http://www.w3.org/2000/01/rdf-schema#'>
  <!ENTITY xsd 'http://www.w3.org/2001/XMLSchema#'>
  <!ENTITY owl 'http://www.w3.org/2002/07/owl#'>
  <!ENTITY rdf 'http://www.w3.org/1999/02/22-rdf-syntax-ns#'>]>
<rdf:RDF
    xmlns:rdf="&rdf;"
    xmlns:owl="&owl;"
    xmlns:xsd="&xsd;"
    xmlns:rdfs="&rdfs;"
    xml:base="http://example.org.cn/" >
</rdf:RDF>

但是，根据jena的文档说明，我原以为，rdfwriter.write(marray,out1, "http://example.org/"); 执行之后，会将rdfwriter所设置的所有信息都保存到OntModel对象marray中去，可是没有。当我将marray直接输出到一个本体文件中去时发现，rdfwriter好像什么也没有做过一样。我才发现OntModel始终只是一个本体模型，除了描述本体的信息，再不包含多余信息。

求救，我想用jena创建一个完整的owl文件，应该如何做？该owl文件包括xml编码说明，包括DOCTYPE声明，包括xml:base属性设置。